W zależności od ilości danych do przetworzenia generowanie pliku może się wydłużyć.

Jeśli generowanie trwa zbyt długo można ograniczyć dane np. zmniejszając zakres lat.

Artykuł

Pobierz BibTeX

Tytuł

Development of microsatellite loci and optimization of a multiplex assay for Latibulus argiolus (Hymenoptera: Ichneumonidae), the specialized parasitoid of paper wasps

Autorzy

[ 1 ] Pracownia Technik Molekularnych i Biometrycznych, Muzeum i Instytut Zoologii PAN | [ P ] pracownik

Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)

[7.5] Nauki biologiczne

Rok publikacji

2020

Opublikowano w

Scientific Reports

Rocznik: 2020 | Tom: 10 | Numer: 1

Typ artykułu

artykuł naukowy

Język publikacji

angielski

Streszczenie

EN Microsatellite loci are commonly used markers in population genetic studies. In this study, we present 40 novel and polymorphic microsatellite loci elaborated for the ichneumonid parasitoid Latibulus argiolus (Rossi, 1790). Reaction condition optimisation procedures allowed 14 of these loci to be co-amplified in two PCRs and loaded in two multiplex panels onto a genetic analyser. The assay was tested on 197 individuals of L. argiolus originating from ten natural populations obtained from the host nests of paper wasps. The validated loci were polymorphic with high allele numbers ranging from eight to 27 (average 17.6 alleles per locus). Both observed and expected heterozygosity values were high, ranging between 0.75 and 0.92 for HO (mean 0.83) and from 0.70 to 0.90 for HE (mean 0.85). The optimized assay showed low genotyping error rate and negligible null allele frequency. The designed multiplex panels could be successfully applied in relatedness analyses and genetic variability studies of L. argiolus populations, which would be particularly interesting considering the coevolutionary context of this species with its social host.

Strony (od-do)

16068

DOI

10.1038/s41598-020-72923-6

URL

http://www.nature.com/articles/s41598-020-72923-6.pdf

Typ licencji

CC BY (uznanie autorstwa)

Wersja tekstu w otwartym dostępie

ostateczna wersja autorska

Data udostępnienia

30.09.2020

Czas udostępnienia publikacji w sposób otwarty

w momencie opublikowania

Punktacja Ministerstwa / czasopismo

140

Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021

140